Computational Discovery of High-Affinity MCL-1 Binders as Promising Therapeutic Candidates for Breast Cancer.
الكلمات المفتاحية:
سرطان الثدي، مثبطات بروتين MCL-1، دراسة حاسوبية in silico، عائلة Pinnaceae، النباتات الطبية.الملخص
يُعدّ سرطان الثدي أحد الأسباب الرئيسية لوفيات السرطان بين النساء على مستوى العالم، وقد تم التعرف على اختلال تنظيم المسارات الإشارية المرتبطة بعملية الاستماتة (Apoptosis) بوصفه سمة بارزة في نشوء أورام الثدي، حيث يسهم الإفراط في التعبير عن البروتين المضاد للاستماتة Myeloid Cell Leukemia- (MCL-1) بشكل كبير في بقاء الخلايا السرطانية ومقاومتها للعلاج. وبناءً على ذلك، يُعدّ بروتين MCL-1 هدفًا علاجيًا مهمًا لتصميم الأدوية واكتشاف العوامل العلاجية الجديدة .
تركز هذه الدراسة على تحديد وتوصيف مثبطات محتملة لبروتين MCL-1 باستخدام الدراسات الحاسوبية (in silico) تم الحصول على ملف البروتين ذي المعرف PDB ID: 5FDR من بنك بيانات البروتينات (Protein Data Bank)، والذي يتضمن أيضًا جزيئًا مثبطًا صغيرًا، بدقة بنيوية تبلغ 2.60 Å. كما تم استخدام قاعدة بيانات النباتات الطبية الهندية IMPPAT 2.0 لتحديد المركبات النباتية ذات الصلة من عائلة Pinnaceae. حيث تم استخراج 170 مركبًا نباتيًا يحمل إمكانية تثبيط بروتين MCL-1.
أُجري الإرساء الجزيئي باستخدام برنامج Molegro Virtual Docker 2013 V6.0، في حين استخدم خادم Protein Plus لإظهار التفاعلات الثنائية الأبعاد بين الليغاندات والبروتين. ومن خلال دراسة الإرساء الجزيئي للمركبات
الـ 170، تبين أن 10 مركبات أظهرت درجات MolDock Score عالية تتراوح بين –120.39 إلى –144.272. كما كشفت دراسة الحرائك الدوائية باستخدام خادم SwissADME عن وجود 3 مركبات (IMPHY000001) و (IMPHY003007) و (IMPHY012983) دون أي خرق لقاعدة ليبنسكي الخماسية، مما يمنحها خصائص عالية بالأدوية (Drug-likeness)..
تشير نتائج هذه الدراسة إلى أن المركبات النباتية المستخلصة من عائلة Pinnaceae، ولا سيما المركبات IMPHY000001 و IMPHY003007 و IMPHY012983، تمتلك إمكانية أن تكون عوامل علاجية ضد سرطان الثدي. وتبقى الحاجة ملحة لإجراء مزيد من الدراسات لتأكيد هذه النتائج في البيئات التجريبية والسريرية.
